離子色譜的分離機(jī)理主要是離子交換，有3種分離方式：高效離子交換色譜（HPIC）、離子排斥色譜（HPIEC）和離子對(duì)色譜（MPIC）。用于3種分離方式的柱填料的樹(shù)脂骨架基本都是苯乙烯-二乙烯基苯的共聚物，但樹(shù)脂的離子交換功能基和容量各不相同。HPIC用低容量的離子交換樹(shù)脂，離子色譜用高容量的樹(shù)脂，MPIC用不含離子交換基團(tuán)的多孔樹(shù)脂。離子對(duì)色譜的主要分離機(jī)理是吸附與分配。固定相常用的低極性的十八烷基或八烷基鍵合硅膠。通過(guò)在流動(dòng)相中加入一種與溶質(zhì)離子帶相反電荷的離子對(duì)試劑，使之與溶質(zhì)離子形成中性的疏水性化合物。離子色譜基本上可采用通常的反相高效液相色譜的分離體系。

　　離子色譜的分析原理決定了它的淋洗液一般是酸、堿、鹽或絡(luò)合物的水溶液，因此整個(gè)輸液系統(tǒng)必須耐酸、堿，在整個(gè)流路系統(tǒng)中必須考慮使用非金屬材料，這就是與高效液相色譜金屬輸液系統(tǒng)明顯的不同點(diǎn)。首先淋洗液儲(chǔ)液瓶，儲(chǔ)液瓶一般采用“HDPE”(中文名稱(chēng)為高密度聚乙烯）材料組成，該瓶必須具有一定的耐壓防爆能力以及良好的耐化學(xué)藥品性。在色譜的流路系統(tǒng)中盡可能采用上述材料的儲(chǔ)液瓶，盡量少用玻璃瓶，基本上不使用聚氯乙烯材料制成的儲(chǔ)液瓶，因?yàn)榫勐纫蚁┧芰掀吭谑褂眠^(guò)程中會(huì)溶解出微量的C1-，特別在痕量分析過(guò)程中會(huì)干擾C1-的分析。離子色譜的檢測(cè)器分為兩大類(lèi)，即電化學(xué)檢測(cè)器和光學(xué)檢測(cè)器。隨著色譜的廣泛應(yīng)用，色譜的檢測(cè)技術(shù)已由單一的化學(xué)抑制型電導(dǎo)法發(fā)展為包括電化學(xué)光化學(xué)和與其他多種分析儀器聯(lián)用的方法。

　　離子色譜的優(yōu)點(diǎn)：
　　1、快速、方便：一般而言，IC分析一個(gè)樣品平均只需約10min。對(duì)幾種常見(jiàn)陰離子和陽(yáng)離子的平均分析時(shí)間可小于8min。
　　2、靈敏度高：離子色譜分析的濃度范圍為幾μg／L（1～10μg／L）至數(shù)百mg／L。直接進(jìn)樣（25μL），電導(dǎo)檢測(cè)，對(duì)常見(jiàn)陰離子的檢出限小于10μg／L。
　　3、選擇性好：IC法分析無(wú)機(jī)和有機(jī)陰、陽(yáng)離子的選擇性可通過(guò)選擇恰當(dāng)?shù)姆蛛x方式、分離柱和檢測(cè)方法來(lái)達(dá)到。
　　4、多離子同時(shí)分析：在20min左右時(shí)間內(nèi)，實(shí)現(xiàn)10個(gè)以上離子的同時(shí)分離已是一件很容易的事。含量相差數(shù)百倍或上千倍的不同離子也可一次進(jìn)樣同時(shí)準(zhǔn)確定量。
　　5、分離柱的穩(wěn)定性好：IC柱填料的高pH值穩(wěn)定性允許用強(qiáng)酸或強(qiáng)堿作淋洗液，有利于擴(kuò)大應(yīng)用范圍。